RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 CALM2P0DP24 149 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 CALM3P0DP25 149 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 Q3C1V9 767 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 KIFC2Q96AC6 838 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 BTBD7Q9P203 1132 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 PEX10O60683 326 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 FDX1P10109 184 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 SLC16A2P36021 539 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 SP3Q02447 781 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 APOA5Q6Q788 366 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 REPS2Q8NFH8 660 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 MYL10Q9BUA6 226 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 NEK4P51957 841 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 RCAN1P53805 252 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 APOBRQ0VD83 1088 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 FANCBQ8NB91 859 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 RLFQ13129 1914 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 KLRF2D3W0D1 207 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 FKTNO75072 461 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 ZBED4O75132 1171 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 LBX1P52954 281 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 ERVK-9P63128 1117 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 ERVK-24P63145 666 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF548-204ENST00000594693 ATP2A1O14983 1001 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ZBTB43O43298 467 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 SMARCA1P28370 1054 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 KIF5BP33176 963 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CPVLQ9H3G5 476 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RXRAP19793 462 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 GNAQP50148 359 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 OAZ1P54368 228 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 MICU3Q86XE3 530 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 STAT3P40763 770 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 AK2P54819 239 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CCNA1P78396 465 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 PPP2R5BQ15173 497 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RABEP1Q15276 862 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD1Q15327 319 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 NBPF11Q86T75 865 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 IL27Q8NEV9 243 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 MTMR8Q96EF0 704 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF536O15090 1300 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CYTH3O43739 400 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CTGFP29279 349 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 SNAP25P60880 206 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CAP1Q01518 475 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ERO1AQ96HE7 468 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 PARP14Q460N5 1801 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 PLS1Q14651 629 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 KIF22Q14807 665 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RTN1Q16799 776 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CPXCR1Q8N123 301 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 PORCNQ9H237 461 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF548-204ENST00000594693 NID2Q14112 1375 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms