RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591307.5

BECN1-218, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 2

Gene BECN1, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-218ENST00000591307 FEM1BQ9UK73 627 aa20.96■□□□□ 0.95
BECN1-218ENST00000591307 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.96■□□□□ 0.95
BECN1-218ENST00000591307 NEDD4P46934 1319 aa20.96■□□□□ 0.95
BECN1-218ENST00000591307 HIP1O00291 1037 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SLC4A3P48751 1232 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SNAP25P60880 206 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.95■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 FCER1AP12319 257 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 CHMLP26374 656 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 GMCL1Q96IK5 515 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 MMP19Q99542 508 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.94■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 CEP290O15078 2479 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ZNF213O14771 459 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ZBED4O75132 1171 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SLC1A4P43007 532 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.93■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 PTH1RQ03431 593 aa20.92■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.92■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 DPF3Q92784 378 aa20.92■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 MAML3Q96JK9 1138 aa20.92■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.92■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 H0YGN5 161 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ATP2A1O14983 1001 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ZNF536O15090 1300 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 CYBAP13498 195 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 CNGA1P29973 690 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.91■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ALPK3Q96L96 1907 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 B4E1Z4 1266 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 SLC16A2P36021 539 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 ANO1Q5XXA6 986 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 LAMA4Q16363 1823 aa20.9■□□□□ 0.94
BECN1-218ENST00000591307 KDM4AO75164 1064 aa20.89■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 STAT2P52630 851 aa20.89■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.89■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.89■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.89■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 PLA2G6O60733 806 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 KCTD2Q14681 263 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 CCDC96Q2M329 555 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 FAM160B2Q86V87 743 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 FGD4Q96M96 766 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 PFASO15067 1338 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 CCDC174Q6PII3 467 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 DCAF4Q8WV16 495 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 ESR2Q92731 530 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.87■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 PDHBP11177 359 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 CAPN2P17655 700 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 COPB2P35606 906 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 TTC14Q96N46 770 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 TINF2Q9BSI4 451 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 SGSM2O43147 1006 aa20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 COL6A1P12109 1028 aa20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 OAZ1P54368 228 aa20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 DDX11Q96FC9 970 aa20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 CPVLQ9H3G5 476 aa20.85■□□□□ 0.93
BECN1-218ENST00000591307 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms