RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587700.1

RFX2-209, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 2

Gene RFX2, Length 2,376 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-209	ENST00000587700	CUL4B	Q13620	913 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	SPECC1	Q5M775	1068 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TAF1	P21675	1872 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	MFAP3L	O75121	409 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GNAT2	P19087	354 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ST5	P78524	1137 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	EVX2	Q03828	476 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZNF827	Q17R98	1081 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CNGA4	Q8IV77	575 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GUCY1A2	P33402	732 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	MTF1	Q14872	753 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	WTAP	Q15007	396 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	HDX	Q7Z353	690 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	NEK11	Q8NG66	645 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ERICH2	A1L162	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	RBL2	Q08999	1139 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	FERMT2	Q96AC1	680 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CTAGE9	A4FU28	777 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TRIM75P	A6NK02	468 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TEX33	O43247	280 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CYP7A1	P22680	504 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	C1QTNF8	P60827	252 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TRIM14	Q14142	442 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZNF384	Q8TF68	577 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	PRDM1	O75626	825 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CAPN2	P17655	700 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	XBP1	P17861	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	DPYD	Q12882	1025 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CAMK2B	Q13554	666 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZSCAN26	Q16670	478 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	NME8	Q8N427	588 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	FANCB	Q8NB91	859 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CHD4	Q14839	1912 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700		H3BQF6	201 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	SPAG1	Q07617	926 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	NR5A1	Q13285	461 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RFX2-209	ENST00000587700	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74

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