RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582453.5

MSI2-215, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-215	ENST00000582453	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453		A0A087WZG4	1122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	PAX4	O43316	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	GSN	P06396	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	ITGA4	P13612	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	CD247	P20963	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	BMP8B	P34820	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	DUSP4	Q13115	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	HAUS7	Q99871	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-215	ENST00000582453	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	HPX	P02790	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	SYP	P08247	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CTSK	P43235	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	HK2	P52789	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF445	P59923	1031 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	OXR1	Q8N573	874 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FAM168A	Q92567	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	WHRN	Q9P202	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	MEIS1	O00470	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF205	O95201	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CHRNE	Q04844	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	NCAPH	Q15003	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	NR0B2	Q15466	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	CUX1	P39880	1505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FKTN	O75072	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	EPHX1	P07099	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	VAV1	P15498	845 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ETFB	P38117	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	BRF1	Q92994	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-215	ENST00000582453	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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