RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MKL1Q969V6 931 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCDHA6Q9UN73 950 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CSRNP2Q9H175 543 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRBA2Q6ZNG9 492 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RASGRP4Q8TDF6 673 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CSRNP1Q96S65 589 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADCY5O95622 1261 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CXCL9Q07325 125 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HS1BP3Q53T59 392 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTGDRQ13258 359 aa30.2■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C6orf50Q9HD87 102 aa30.2■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLRN2A0PK11 232 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GNA11P29992 359 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LONRF3Q496Y0 759 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNNM3Q8NE01 707 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ESYT2A0FGR8 921 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM151AQ8WW52 585 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 JDP2Q8WYK2 163 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMCO2A6NFE2 343 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SEPT2Q15019 361 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQCB1Q15051 598 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC96Q2M329 555 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AP5Z1O43299 807 aa30.17■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MCM7P33993 719 aa30.17■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ICA1Q05084 483 aa30.17■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.17■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.17■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A087WWV3 80 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NFKBIEO00221 500 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GDF11O95390 407 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 JMJD4Q9H9V9 463 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLCB2Q00722 1185 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP49Q70CQ1 688 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGRF4Q8IZF3 695 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DCAF4Q8WV16 495 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNTNAP1P78357 1384 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NLRP12P59046 1061 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 INF2Q27J81 1249 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCTD1Q719H9 257 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC39Q9UFE4 941 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.14■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PNOCQ13519 176 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C4orf32Q8N8J7 132 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VWA3AA6NCI4 1184 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLFN13Q68D06 897 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP1R18Q6NYC8 613 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTMR8Q96EF0 704 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VEZTQ9HBM0 779 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ESPNB1AK53 854 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRIN3BO60391 1043 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GH2P01242 217 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNIP1Q15025 636 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DPCR1Q3MIW9 517 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EPSTI1Q96J88 318 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SERTAD1Q9UHV2 236 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BIN1O00499 593 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYO1BO43795 1136 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC1A4P43007 532 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 JAG1P78504 1218 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KANK3Q6NY19 840 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM83AQ86UY5 434 aa30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms