RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 BMP3P12645 472 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 PRKG1Q13976 671 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 VCPKMTQ9H867 229 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 OTOFQ9HC10 1997 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 NAPAP54920 295 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 ATL3Q6DD88 541 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 TNFRSF25Q93038 417 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 SH2D4AQ9H788 454 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.35■□□□□ 0.85
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HERC2-208ENST00000566635 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 UBE2HP62256 183 aa20.34■□□□□ 0.85
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HERC2-208ENST00000566635 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 KLRG1Q96E93 195 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 MTMR8Q96EF0 704 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 FEZ1Q99689 392 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.34■□□□□ 0.85
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HERC2-208ENST00000566635 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC2-208ENST00000566635 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.33■□□□□ 0.85
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HERC2-208ENST00000566635 SNAP25P60880 206 aa20.33■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.33■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PGBD1Q96JS3 809 aa20.33■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 GINM1Q9NU53 330 aa20.33■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.33■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB5O15062 677 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 MBD3O95983 291 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 BLIDQ8IZY5 108 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 12.2
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HERC2-208ENST00000566635 PTPRAP18433 802 aa20.3■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 CDCA5Q96FF9 252 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 SMCO2A6NFE2 343 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 M0R2N6 131 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 YEATS4O95619 227 aa20.3■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 POTEJP0CG39 1038 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 ATP2B1P20020 1258 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 STAT2P52630 851 aa20.3■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.3■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 SPP2Q13103 211 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PTPAQ15257 358 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.29■□□□□ 0.84
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HERC2-208ENST00000566635 ME1P48163 572 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 GALNT17Q6IS24 598 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 C6orf50Q9HD87 102 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 ESYT2A0FGR8 921 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC2-208ENST00000566635 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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