RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	PLIN1	O60240	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RASGRP1	O95267	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	WNT11	O96014	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RHBDL3	P58872	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GSC2	O15499	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CAND2	O75155	1236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NPTXR	O95502	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FGFR1	P11362	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MAOB	P27338	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GRK4	P32298	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GNAL	P38405	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MCL1	Q07820	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	BIRC2	Q13490	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	APBA2	Q99767	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HAUS7	Q99871	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF862	O60290	1169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ECEL1	O95672	775 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	EYA4	O95677	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GRIK1	P39086	918 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NEK2	P51955	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RGS13	O14921	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	BRINP1	O60477	761 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	EFCAB14	O75071	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	KATNA1	O75449	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ITGAV	P06756	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	EPHX1	P07099	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SDS	P20132	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CDC25B	P30305	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ERVK-24	P63145	666 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DHCR24	Q15392	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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