RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 SPATA32Q96LK8 384 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 USP28Q96RU2 1077 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 CPVLQ9H3G5 476 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 ELP1O95163 1332 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 BTBD18B2RXH4 712 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 SLFN14P0C7P3 912 aa20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 CNPY4Q8N129 248 aa20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 MYH6P13533 1939 aa20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 MBD3O95983 291 aa20.27■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 UBE2HP62256 183 aa20.27■□□□□ 0.84
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GDE1-203ENST00000564172 ZNF543Q08ER8 600 aa20.27■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.27■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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GDE1-203ENST00000564172 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 CAP2P40123 477 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GPR162Q16538 588 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.26■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 NR5A1Q13285 461 aa20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 OXER1Q8TDS5 423 aa20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 NPY5RQ15761 445 aa20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.25■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 MYH4Q9Y623 1939 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 A0A1W2PRG0 241 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 F5H6K3 240 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 KLRC3Q07444 240 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SLFN13Q68D06 897 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.24■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 RAD21O60216 631 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 CCDC96Q2M329 555 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 KCTD1Q719H9 257 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GGA3Q9NZ52 723 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 CLIC4Q9Y696 253 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 KRT2P35908 639 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SLC1A4P43007 532 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 NLRP5P59047 1200 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 HOMER1Q86YM7 354 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 DCAF4Q8WV16 495 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 PIGSQ96S52 555 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 PGBD1Q96JS3 809 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 BARHL2Q9NY43 387 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ASNSP08243 561 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 NDUFB10O96000 172 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ECE1P42892 770 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ANO1Q5XXA6 986 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 ACER1Q8TDN7 264 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 TMX2Q9Y320 296 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 STXBP3O00186 592 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 YEATS4O95619 227 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 SLC16A2P36021 539 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GMCL1Q96IK5 515 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GDE1-203ENST00000564172 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.2■□□□□ 0.82
GDE1-203ENST00000564172 CALML3P27482 149 aa20.2■□□□□ 0.82
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