RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 DISC1Q9NRI5 854 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 BTAF1O14981 1849 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 ADGRB1O14514 1584 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 PASKQ96RG2 1323 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 MMP10P09238 476 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 ID3Q02535 119 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 PDE4CQ08493 712 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 PI16Q6UXB8 463 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 FLCNQ8NFG4 579 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 STK35Q8TDR2 534 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 BCO2Q9BYV7 579 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 U3KQE9 123 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 SZT2Q5T011 3432 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 USP47Q96K76 1375 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC1-211ENST00000560983 AKAP12Q02952 1782 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 A0A0C4DFX4 3053 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 RASSF10A6NK89 507 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 TREHO43280 583 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 PAPLNO95428 1278 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NEFMP07197 916 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 SLFN14P0C7P3 912 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 FCGRTP55899 365 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 MISP3Q96FF7 219 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 FAM87AP0C7U9 286 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ARNTP27540 789 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ERVK-24P63145 666 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 CDK5R2Q13319 367 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 TTLL4Q14679 1199 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 DEFB115Q30KQ5 88 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 SPRED2Q7Z698 418 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 SULF2Q8IWU5 870 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 TMC1Q8TDI8 760 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 LMNB1P20700 586 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NME2P22392 152 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NTF4P34130 210 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 OGFOD2Q6N063 350 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 RNF214Q8ND24 703 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NETO1Q8TDF5 533 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ASIC4Q96FT7 647 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 PIDD1Q9HB75 910 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 LGR6Q9HBX8 967 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 BRD1O95696 1058 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 FUT4P22083 530 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 CHRNA5P30532 468 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 OXCT1P55809 520 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 SOX10P56693 466 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 TMF1P82094 1093 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 RING1Q06587 406 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HERC1-211ENST00000560983 ISL2Q96A47 359 aa5.49□□□□□ -1.53
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