RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PRG0 241 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 F5H6K3 240 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 STXBP3O00186 592 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRIN3BO60391 1043 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRE11P49959 708 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLRC3Q07444 240 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCTD1Q719H9 257 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 GMCL1Q96IK5 515 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 BARHL2Q9NY43 387 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASNSP08243 561 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALML3P27482 149 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC1A4P43007 532 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 BLIDQ8IZY5 108 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOOK2Q96ED9 719 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 GINM1Q9NU53 330 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMX2Q9Y320 296 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PQ27 194 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PQ64 194 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PQD8 194 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GVL5 298 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP6R2O75170 966 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFB10O96000 172 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC16A2P36021 539 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF15Q66K64 600 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 JMYQ8N9B5 988 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBSNQ9H1K0 784 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPY26PQ9H489 355 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ECE1P42892 770 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAPAP54920 295 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNMDQ9H2S6 317 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM75PA6NK02 468 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 GALNT17Q6IS24 598 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACER1Q8TDN7 264 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTMR8Q96EF0 704 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLIC6Q96NY7 704 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFA8P51970 172 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNT7AO00755 349 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K11Q16584 847 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH2D4AQ9H788 454 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOPCQ9HD26 462 aa20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L10C9JJH3 530 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 BMP3P12645 472 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CMA1P23946 247 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF174Q15697 407 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 COA7Q96BR5 231 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PANK2Q9BZ23 570 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.39■□□□□ 0.86
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMCO2A6NFE2 343 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLTPD2A6NH11 291 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 KINO60870 393 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 CUTAO60888 179 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC38Q5R3I4 469 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0R2N6 131 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHC4Q6S5L8 630 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 VCPKMTQ9H867 229 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms