RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CNR2	P34972	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ACVRL1	P37023	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK8	P45983	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNA1	Q09470	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	NOBOX	O60393	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	HTRA3	P83110	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N1X5	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GTL3	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCG1	P19174	1290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TNNI2	P48788	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FBLN1	P23142	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4F8	P98187	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	NR1I3	Q14994	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCA	P17252	672 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LIG3	P49916	1009 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	GJA9	P57773	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQY0	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FKTN	O75072	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	SYP	P08247	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXO4	P98177	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	CARF	Q8N187	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD7	O75084	574 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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