RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 M0R2N6 131 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 N4BP3O15049 544 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRCPP42785 496 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAK1Q13153 545 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRM4Q14833 912 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 SBF2Q86WG5 1849 aa22.58■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.58■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.58■■□□□ 1.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABL1P00519 1130 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC15Q8TF66 581 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.58■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 DISC1Q9NRI5 854 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 BTAF1O14981 1849 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNJ18B7U540 433 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNJ12Q14500 433 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEX35Q5T0J7 233 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 STXBP3O00186 592 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGL2O15211 777 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRAPQ13588 217 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.56■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 RASA1P20936 1047 aa22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TXLNAP40222 546 aa22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERVK-24P63145 666 aa22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKS1AQ92625 1134 aa22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 RFC4P35249 363 aa22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.55■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.54■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.54■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 BARHL2Q9NY43 387 aa22.54■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAG3O95817 575 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS72Q15906 364 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNGA4Q8IV77 575 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.53■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLRF2D3W0D1 207 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 BTDP43251 543 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPSM2P81274 684 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 RMND1Q9NWS8 449 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBA7P41226 1012 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNBD1Q8NA66 436 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.52■■□□□ 1.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLRC4O43908 158 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNAQP50148 359 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP4CP60510 307 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBXN1Q04323 297 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADSSL1Q8N142 457 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.51■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLA2G4AP47712 749 aa22.5■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK8P49336 464 aa22.5■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSTO1P78417 241 aa22.5■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 LETM2Q2VYF4 491 aa22.5■■□□□ 1.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.5■■□□□ 1.19
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