RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 KCNA10Q16322 511 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 CPXCR1Q8N123 301 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 KANSL2Q9H9L4 492 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 MYH7P12883 1935 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 DNAJB2P25686 324 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 DDX11Q96FC9 970 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.696e-7■□□□□ 9.5
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CS-227ENST00000551441 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 MCM3APO60318 1980 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 DCDC2CA8MYV0 355 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 ADCY6O43306 1168 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 ACRP10323 421 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 PBX2P40425 430 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 HAUS7Q99871 368 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 SLF1Q9BQI6 1058 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 FAM184BQ9ULE4 1060 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 COG6Q9Y2V7 657 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-227ENST00000551441 MINDY4BA8MYZ0 360 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TIMP1P01033 207 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ATP5JP18859 108 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 C16orf59Q7L2K0 433 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 NUP133Q8WUM0 1156 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ZNF576Q9H609 170 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 F5H6K3 240 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 NDUFB10O96000 172 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 RASA1P20936 1047 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 KLRC3Q07444 240 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 KIFC2Q96AC6 838 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TIFAQ96CG3 184 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TOX2Q96NM4 488 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 MKNK2Q9HBH9 465 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CHD9Q3L8U1 2897 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 HMMRO75330 724 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ASGR1P07306 291 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CSF2RAP15509 400 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ACVR2BQ13705 512 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 UBE3CQ15386 1083 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 PRDM12Q9H4Q4 367 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TBX21Q9UL17 535 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 MYH4Q9Y623 1939 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ROBO3Q96MS0 1386 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TMEM265A0A087WTH1 108 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 MOXD2PA6NHM9 499 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 RAB11FIP3O75154 756 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 PRDM1O75626 825 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 PTGS1P23219 599 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 COPB2P35606 906 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 BEX3Q00994 111 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TMEM240Q5SV17 173 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 MFSD5Q6N075 450 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ANKRD35Q8N283 1001 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 FGD4Q96M96 766 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 GLT1D1Q96MS3 346 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 PBX4Q9BYU1 374 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 HOMER2Q9NSB8 354 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
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CS-227ENST00000551441 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 MYO9BQ13459 2157 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 GSG1L2A8MUP6 293 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CYP2C18P33260 490 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 CDK7P50613 346 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 TJAP1Q5JTD0 557 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-227ENST00000551441 GNASQ5JWF2 1037 aa19.28■□□□□ 0.68
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