RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SAMM50Q9Y512 469 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CSADQ9Y600 493 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FANCGO15287 622 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PAGE1O75459 146 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ALDH1L1O75891 902 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM37O94972 964 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 BMP6P22004 513 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PMLP29590 882 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 NTF4P34130 210 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PAK2Q13177 524 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MORC3Q14149 939 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ALFQ53S48 1182 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM168AQ92567 244 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PICK1Q9NRD5 415 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNG1Q9UIX4 513 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MCM8Q9UJA3 840 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CBFA2T2O43439 604 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO24O75426 580 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 POLD1P28340 1107 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RING1Q06587 406 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB33AQ14088 237 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC14Q15048 493 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC96Q2M329 555 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 KSR2Q6VAB6 950 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 C12orf40Q86WS4 652 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC39A13Q96H72 371 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 INTUQ9ULD6 942 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SPG7Q9UQ90 795 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 AK5Q9Y6K8 562 aa4.35□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ESYT3A0FGR9 886 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GIPC1O14908 333 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TCEA2Q15560 299 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RASIP1Q5U651 963 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CPXCR1Q8N123 301 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 KCT2Q8NC54 265 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ASB11Q8WXH4 323 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 E2F7Q96AV8 911 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC14Q96N46 770 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SETDB2Q96T68 719 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PPCSQ9HAB8 311 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM260Q9NX78 707 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 POLG2Q9UHN1 485 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PLAAQ9Y263 795 aa4.34□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms