RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 TUBB4BP68371 445 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 CCDC93Q567U6 631 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 SOGA3Q5TF21 947 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TMEM139Q8IV31 216 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TC2NQ8N9U0 490 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 MNS1Q8NEH6 495 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TSC1Q92574 1164 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 EYA3Q99504 573 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 DISC1Q9NRI5 854 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 OGFRQ9NZT2 677 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 SBF2Q86WG5 1849 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 SNED1Q8TER0 1413 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 FECHP22830 423 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 CASQ1P31415 396 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 PBX1P40424 430 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 NOVP48745 357 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 CDK8P49336 464 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 GPSM2P81274 684 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 AMPD3Q01432 767 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 STX8Q9UNK0 236 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 PSMA7O14818 248 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 MFAP3LO75121 409 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 SERPINB2P05120 415 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 OR52Z1P0C646 297 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 NAPAP54920 295 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 NELFBQ8WX92 580 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 IQCDQ96DY2 449 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 THAP9Q9H5L6 903 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 SWAP70Q9UH65 585 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 TAF1P21675 1872 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 FLT1P17948 1338 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-205ENST00000546891 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 BICDL2A1A5D9 508 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 USP17L3A6NCW0 530 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 USP17L4A6NCW7 530 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 KLRF2D3W0D1 207 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 WNT7AO00755 349 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 N4BP3O15049 544 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 NEK8Q86SG6 692 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 UBXN4Q92575 508 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 MED15Q96RN5 788 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 RAB34Q9BZG1 259 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 COA1Q9GZY4 146 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 JAG2Q9Y219 1238 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PQC6 194 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 KCNJ18B7U540 433 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 SLC26A4O43511 780 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms