RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.27□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.27□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.27□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 VAMP1P23763 118 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 CAP2P40123 477 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 AFMP43652 599 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 MLECQ14165 292 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.26□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PIK3C2GO75747 1445 aa7.26□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 H3BS24 57 aa7.25□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.25□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 SV2BQ7L1I2 683 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 CRELD1Q96HD1 420 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 KIRREL1Q96J84 757 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 REREQ9P2R6 1566 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.24□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 ERVK-7P63135 1459 aa7.24□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 ZMYM3Q14202 1370 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 ADGRB1O14514 1584 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRDN-205ENST00000546248 SEPT6Q14141 434 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 HID1Q8IV36 788 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 MROH2AA6NES4 1674 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 USP31Q70CQ4 1352 aa7.21□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.21□□□□□ -1.25
TRDN-205ENST00000546248 PIK3C2BO00750 1634 aa7.21□□□□□ -1.26
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TRDN-205ENST00000546248 RAP1GAPP47736 663 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.21□□□□□ -1.26
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TRDN-205ENST00000546248 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.21□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 IQGAP1P46940 1657 aa7.21□□□□□ -1.26
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TRDN-205ENST00000546248 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.21□□□□□ -1.26
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TRDN-205ENST00000546248 GFRA2O00451 464 aa7.2□□□□□ -1.26
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TRDN-205ENST00000546248 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.2□□□□□ -1.26
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TRDN-205ENST00000546248 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KRT1P04264 644 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 CDH24Q86UP0 819 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 STK26Q9P289 416 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.19□□□□□ -1.26
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.18□□□□□ -1.26
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