RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

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Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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LIMK1-208ENST00000538333 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMK1-208ENST00000538333 PTPN14Q15678 1187 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMK1-208ENST00000538333 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.91■□□□□ 0.14
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LIMK1-208ENST00000538333 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.9■□□□□ 0.14
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LIMK1-208ENST00000538333 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.87■□□□□ 0.13
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LIMK1-208ENST00000538333 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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LIMK1-208ENST00000538333 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 USP40Q9NVE5 1235 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 SWAP70Q9UH65 585 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 SIPA1L1O43166 1804 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 SHMT1P34896 483 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMK1-208ENST00000538333 PBX1P40424 430 aa15.85■□□□□ 0.13
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