RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 COBLO75128 1261 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SNAP25P60880 206 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 MROH8Q9H579 483 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 RIPK3Q9Y572 518 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 GJA8P48165 433 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ZBED4O75132 1171 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SLC25A27O95847 323 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 STAT2P52630 851 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 DPP9Q86TI2 863 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PGK2P07205 417 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CYP21A2P08686 494 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 HOXC6P09630 235 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 SLC16A2P36021 539 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 MMP19Q99542 508 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 RPTORQ8N122 1335 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 STRNO43815 780 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 SGPL1O95470 568 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 FCER1AP12319 257 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CYP2C19P33261 490 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 FAM160B2Q86V87 743 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 DCAF4Q8WV16 495 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 PDHBP11177 359 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC174Q6PII3 467 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF536O15090 1300 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 TNKSO95271 1327 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 IQCA1Q86XH1 822 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 KRT23Q9C075 422 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ATP2A1O14983 1001 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 TRPV1Q8NER1 839 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 MAP4K1Q92918 833 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 TTC14Q96N46 770 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 IGHA2P01877 340 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 COPB2P35606 906 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF543Q08ER8 600 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 KCTD2Q14681 263 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 PNMA1Q8ND90 353 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 MAML3Q96JK9 1138 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 CPVLQ9H3G5 476 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-211ENST00000531385 E7EWF7 191 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 PLA2G6O60733 806 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 DGKHQ86XP1 1220 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 KAT14Q9H8E8 782 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 SNHG28P0DPA3 235 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 ALAS1P13196 640 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 CNGA1P29973 690 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF792Q3KQV3 632 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms