RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR78Q5VTH9 848 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP2A1O14983 1001 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBED4O75132 1171 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 REC8O95072 547 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A27O95847 323 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 FDX1P10109 184 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GRK4P32298 578 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ANTXR2P58335 489 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MORN1Q5T089 497 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MROH8Q9H579 483 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ADCY3O60266 1144 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPREP23469 700 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 COPB2P35606 906 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 STAT3P40763 770 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF543Q08ER8 600 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF11Q86T75 865 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 USP6NLQ92738 828 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF333Q96JL9 665 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ERICH2A1L162 156 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OAZ1P54368 228 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GRB14Q14449 540 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CHST3Q7LGC8 479 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MTA3Q9BTC8 594 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2B6P20813 491 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS2P41220 211 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP2K5Q13163 448 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 WTAPQ15007 396 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CPXCR1Q8N123 301 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 STRNO43815 780 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ELNP15502 786 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM5P33992 734 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPA4P34932 840 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC16A2P36021 539 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 RASEFQ8IZ41 740 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 APBA2Q99767 749 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 PRC1O43663 620 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT32Q14532 448 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNB2Q92953 911 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF536O15090 1300 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM87BQ96K49 555 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 NEK1Q96PY6 1258 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SENP2Q9HC62 589 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 RIPK3Q9Y572 518 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPFP49454 3210 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM3APO60318 1980 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGCRP04035 888 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXC6P09630 235 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 FCER1AP12319 257 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ADORA2AP29274 412 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 UBXN2AP68543 259 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIB2Q92519 343 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 LY9Q9HBG7 655 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 LCTP09848 1927 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 INHAP05111 366 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 SNAP25P60880 206 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC174Q6PII3 467 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-208ENST00000531226 MMP19Q99542 508 aa22.22■■□□□ 1.15
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