RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 ANO1Q5XXA6 986 aa22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 FAM227BQ96M60 508 aa22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 INCENPQ9NQS7 918 aa22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 TSPY3P0CV98 308 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 TSPY8P0CW00 308 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 TFAP4Q01664 338 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 TINF2Q9BSI4 451 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 LNPKQ9C0E8 428 aa22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 FGRP09769 529 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 NOVP48745 357 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 AAMPQ13685 434 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 KCTD2Q14681 263 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ALX1Q15699 326 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 FGD4Q96M96 766 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.39■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 SLFN13Q68D06 897 aa22.38■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 FEM1BQ9UK73 627 aa22.38■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 NMT2O60551 498 aa22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 SNX17Q15036 470 aa22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 LRRC41Q15345 812 aa22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 TICAM2Q86XR7 235 aa22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 KIFC2Q96AC6 838 aa22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 GMCL1Q96IK5 515 aa22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ZMYM6O95789 1325 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ORC4O43929 436 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 IGHDP01880 384 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 BMP3P12645 472 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 CPXCR1Q8N123 301 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 LRCH3Q96II8 777 aa22.36■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ZNF536O15090 1300 aa22.35■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 OAZ1P54368 228 aa22.35■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.35■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.35■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 ZBED4O75132 1171 aa22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 FGAP02671 866 aa22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 RTP1P59025 263 aa22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 TSPY2A6NKD2 308 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 TMEM232C9JQI7 657 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 KBTBD13C9JR72 458 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 PLA2G6O60733 806 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 STAT2P52630 851 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 NUCB1Q02818 461 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.33■■□□□ 1.17
CTTN-211ENST00000527622 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 ADAMTS4O75173 837 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 MCCP23508 829 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 TDHQ8IZJ6 230 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 CHST13Q8NET6 341 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 STX8Q9UNK0 236 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 PHF24Q9UPV7 400 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 CDH23Q9H251 3354 aa22.32■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 A0A0C4DFX4 3053 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 RARBP10826 455 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 AKR1A1P14550 325 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 SLC1A4P43007 532 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 FAM160B2Q86V87 743 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 ADCY6O43306 1168 aa22.3■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 PGK1P00558 417 aa22.3■■□□□ 1.16
CTTN-211ENST00000527622 FDX1P10109 184 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms