RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 MST1RQ04912 1400 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC11Q96J66 1382 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ITGAEP38570 1179 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K11Q16584 847 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 DLC1Q96QB1 1528 aa6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3C2GO75747 1445 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ITIH2P19823 946 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 BRINP3Q76B58 766 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 SV2BQ7L1I2 683 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PHC3Q8NDX5 983 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TINF2Q9BSI4 451 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 GGT7Q9UJ14 662 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.02□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRB2O60241 1585 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PKN1Q16512 942 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 KSR1Q8IVT5 923 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ASB11Q8WXH4 323 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 RHOVQ96L33 236 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF10O15013 1369 aa6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRUQ92729 1446 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 IGSF3O75054 1194 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 LIG3P49916 1009 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PPM1JQ5JR12 505 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 USP48Q86UV5 1035 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ACSBG1Q96GR2 724 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 SLC38A3Q99624 504 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TGIF2Q9GZN2 237 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 CBX8Q9HC52 389 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 METP08581 1390 aa6□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ITSN1Q15811 1721 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 NTF4P34130 210 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 MESP2Q0VG99 397 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FBLN7Q53RD9 439 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM74Q96NL1 305 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 CSADQ9Y600 493 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 SBNO1A3KN83 1393 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM37O94972 964 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 PF4P02776 101 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 CDK8P49336 464 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ZP2Q05996 745 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 RING1Q06587 406 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 IKZF1Q13422 519 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FAM84AQ96KN4 292 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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