RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 LARGE1O95461 756 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RPS6KB1P23443 525 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ST3GAL1Q11201 340 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RNF20Q5VTR2 975 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RUFY3Q7L099 469 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 CHST3Q7LGC8 479 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 OGFOD1Q8N543 542 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TEPSINQ96N21 525 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SENP2Q9HC62 589 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 PARP14Q460N5 1801 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ORC4O43929 436 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ENTPD3O75355 529 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 SHMT1P34896 483 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 MMP14P50281 582 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NEK4P51957 841 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 AK2P54819 239 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 RAB15P59190 212 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 DLK2Q6UY11 383 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 HPS1Q92902 700 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NEK1Q96PY6 1258 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 HACL1Q9UJ83 578 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXA13-202ENST00000518136 NR3C2P08235 984 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 RASA1P20936 1047 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 JAG1P78504 1218 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 KRT32Q14532 448 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 FAM151AQ8WW52 585 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 SNX21Q969T3 373 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ALG2Q9H553 416 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 VEZTQ9HBM0 779 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 GGA3Q9NZ52 723 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ESPNB1AK53 854 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 H7C1D1 291 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 PRC1O43663 620 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 NMT2O60551 498 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 CDK8P49336 464 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 SEC23AQ15436 765 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 FAM83AQ86UY5 434 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 NCOA7Q8NI08 942 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 EHD4Q9H223 541 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 PSMA5P28066 241 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 RASA3Q14644 834 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 Q6ZNB5 142 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 Q6ZUG5 572 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 FBXL16Q8N461 479 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 LY9Q9HBG7 655 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 RLFQ13129 1914 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 ADM5C9JUS6 153 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 DTNBO60941 627 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 AKR1B1P15121 316 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 GUCY1A2P33402 732 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 EPHX2P34913 555 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 NOVP48745 357 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 EVCP57679 992 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 MAP3K10Q02779 954 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 TTC6Q86TZ1 520 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA13-202ENST00000518136 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms