RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCNN1BP51168 640 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP2R5DQ14738 602 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRD3Q15059 726 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NTRK3Q16288 839 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHST12Q9NRB3 414 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLL1O00548 723 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRTAMO95727 393 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BPIP17213 487 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ECI1P42126 302 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GFRA1P56159 465 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP53Q70EK8 1073 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCT2Q8NC54 265 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ISL2Q96A47 359 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNK4Q96J92 1243 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MBIPQ9NS73 344 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNKSO95271 1327 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 M0R2C6 588 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APBA3O96018 575 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF445P59923 1031 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP4K2Q12851 820 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXPE1Q8N323 547 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXQ1Q9C009 403 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIDD1Q9HB75 910 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASXL2Q76L83 1435 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B4E1Z4 1266 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZEB2O60315 1214 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKD3O94806 890 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APPP05067 770 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPXP11678 715 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOXC12P31275 282 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE6BP35913 854 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAP2P40123 477 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL2P60568 153 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF4P78317 190 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCIRG1Q13488 830 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXNQ6DKJ4 435 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYMQ7RTS9 669 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC39A13Q96H72 371 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGF1RP08069 1367 aa6.41□□□□□ -1.38
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