RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515629.5

SLC38A9-223, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2 BASIC

Gene SLC38A9, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-223	ENST00000515629	ECE1	P42892	770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RGS3	P49796	1198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	HSD17B7	P56937	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	GTF2I	P78347	998 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	SRL	Q86TD4	932 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	BCL9	O00512	1426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	COL18A1	P39060	1754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	FAM170A	A1A519	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	KIF5C	O60282	957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	APBA1	Q02410	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ORC1	Q13415	861 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	GRM3	Q14832	879 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	GJA10	Q969M2	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	OPLAH	O14841	1288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ARIH2	O95376	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RAC2	P15153	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CAPN3	P20807	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	IL4R	P24394	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	STRN3	Q13033	797 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629		K7ENM7	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TMCC2	O75069	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TYRP1	P17643	537 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CD151	P48509	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	PRSS12	P56730	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	SATB1	Q01826	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	CCT6B	Q92526	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	NINJ1	Q92982	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A9-223	ENST00000515629	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	PFKP	Q01813	784 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A9-223	ENST00000515629	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms