RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.61■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 FAAP100Q0VG06 881 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 SBK1Q52WX2 424 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 RNF180Q86T96 592 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 RAG1P15918 1043 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 RASA1P20936 1047 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 KCTD2Q14681 263 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 GRIN2CQ14957 1233 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 USP38Q8NB14 1042 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 FPGSQ05932 587 aa21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 OSBP2Q969R2 916 aa21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.58■■□□□ 1.05
ITGA3-215ENST00000515147 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 AKR1A1P14550 325 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 DNAJB2P25686 324 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 COPB2P35606 906 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TOX2Q96NM4 488 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 NYAP2Q9P242 653 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MYO9BQ13459 2157 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 GBF1Q92538 1859 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MYADML2A6NDP7 307 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 F5H6K3 240 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 ACLYP53396 1101 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 KLRC3Q07444 240 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 APPBP2Q92624 585 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 DCTPP1Q9H773 170 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TBX21Q9UL17 535 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 RIPK3Q9Y572 518 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 NDUFB10O96000 172 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 KCNA10Q16322 511 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 GPATCH3Q96I76 525 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.54■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 GPAA1O43292 621 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 ADCY6O43306 1168 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MUC3AQ02505 3323 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 M0R2C6 588 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 PRDM1O75626 825 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TIMP1P01033 207 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 GNAT2P19087 354 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 TDO2P48775 406 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 DDX11Q96FC9 970 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 FGD4Q96M96 766 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF576Q9H609 170 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-215ENST00000515147 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 ATP2A1O14983 1001 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 APPP05067 770 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 CDK7P50613 346 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 RASIP1Q5U651 963 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 CPXCR1Q8N123 301 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 MKL1Q969V6 931 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 CEP95Q96GE4 821 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 ZBED4O75132 1171 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 PBX2P40425 430 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-215ENST00000515147 SLC4A3P48751 1232 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms