RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 TCEAL1Q15170 157 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 EBF1Q9UH73 591 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 GSNP06396 782 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 SYPP08247 313 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FGRP09769 529 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 RAC2P15153 192 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 CTSKP43235 329 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF445P59923 1031 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 NR0B2Q15466 257 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ABHD4Q8TB40 342 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MYLIPQ8WY64 445 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 SP110Q9HB58 689 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM82A0PJX8 343 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 CBFA2T2O43439 604 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 DUSP4Q13115 394 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF124Q15973 351 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 OXR1Q8N573 874 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 HAUS7Q99871 368 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 KCNK12Q9HB15 430 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF205O95201 554 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ITGA4P13612 1032 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 VAV1P15498 845 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ETFBP38117 255 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 CHRNEQ04844 493 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 TNNI3KQ59H18 835 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FITM1A5D6W6 292 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MEIS1O00470 390 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 MESP2Q0VG99 397 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 VHLLQ6RSH7 139 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 LILRA2Q8N149 483 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 BRF1Q92994 677 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 DIRC2Q96SL1 478 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 WHRNQ9P202 907 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-220ENST00000512069 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NCAPHQ15003 741 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SNX17Q15036 470 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 KSR1Q8IVT5 923 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 RNF32Q9H0A6 362 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FKTNO75072 461 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 PPM1BO75688 479 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 EPHX1P07099 455 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ZPBP2Q6X784 338 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 FIBCD1Q8N539 461 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 MAP6Q96JE9 813 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 C8orf37Q96NL8 207 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 GBP3Q9H0R5 595 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-220ENST00000512069 H0Y8X5 98 aa7.31□□□□□ -1.24
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