RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511013.2

AP003555.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP003555.1, Length 1,755 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003555.1-202ENST00000511013 M0R2N6 131 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 FANCGO15287 622 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PRPHP41219 470 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 STIM1Q13586 685 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KCNB1Q14721 858 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 SMIM5Q71RC9 77 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 DESI2Q9BSY9 194 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 DISC1Q9NRI5 854 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 BARHL2Q9NY43 387 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 NAV1Q8NEY1 1877 aa16.06■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KCNJ18B7U540 433 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KIF20AO95235 890 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CASP14P31944 242 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 UBA7P41226 1012 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TUBB4BP68371 445 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KCNJ12Q14500 433 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 MTRQ99707 1265 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CUEDC2Q9H467 287 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 JAG2Q9Y219 1238 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 GYPCP04921 128 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 MTF1Q14872 753 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RABGGTAQ92696 567 aa16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 SBF2Q86WG5 1849 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 MYH8P13535 1937 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 USP17L3A6NCW0 530 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 USP17L4A6NCW7 530 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 STXBP3O00186 592 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 ADAMTS3O15072 1205 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PLCG2P16885 1265 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RFC4P35249 363 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 ADSSL1Q8N142 457 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 GOLGA1Q92805 767 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 NGLY1Q96IV0 654 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 AK8Q96MA6 479 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.04■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 SMARCA1P28370 1054 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 PRCPP42785 496 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 VPS16Q9H269 839 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 NHSQ6T4R5 1651 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RASA1P20936 1047 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 INF2Q27J81 1249 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 SLF2Q8IX21 1173 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 CEP112Q8N8E3 955 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 THAP9Q9H5L6 903 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.03■□□□□ 0.16
AP003555.1-202ENST00000511013 KLRF2D3W0D1 207 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 PSMA7O14818 248 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 RHOBTB3O94955 611 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 GNA11P29992 359 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 PPP1R2P41236 205 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.02■□□□□ 0.15
AP003555.1-202ENST00000511013 CNBD1Q8NA66 436 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms