RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDSP20132 328 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OAZ1P54368 228 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHURC1Q8WUH1 139 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIFC2Q96AC6 838 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STX8Q9UNK0 236 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMYM6O95789 1325 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HIP1O00291 1037 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEPT4O43236 478 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC1A4P43007 532 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM160B2Q86V87 743 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARRDC4Q8NCT1 418 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPV1Q8NER1 839 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INCENPQ9NQS7 918 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLA2G6O60733 806 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCP11498 1178 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STAT2P52630 851 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF792Q3KQV3 632 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPXCR1Q8N123 301 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX11Q96FC9 970 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO40Q9UH90 709 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM232C9JQI7 657 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNM1LO00429 736 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGK2P07205 417 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCCP23508 829 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOVP48745 357 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHST13Q8NET6 341 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TINF2Q9BSI4 451 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOMM22Q9NS69 142 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PARP14Q460N5 1801 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PFASO15067 1338 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NT5C2P49902 561 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C7orf61Q8IZ16 206 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIPK3Q9Y572 518 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NMT2O60551 498 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC4A3P48751 1232 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFSD6Q6ZSS7 791 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRO3102Q9H379 93 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PPC1 479 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKNAD1Q5T1N1 836 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD35Q8N283 1001 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC14Q96N46 770 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYH4Q9Y623 1939 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KBTBD13C9JR72 458 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF213O14771 459 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TKFCQ3LXA3 575 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF4Q8WV16 495 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RARBP10826 455 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BMP8BP34820 402 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HAND2P61296 217 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC26Q2I0M4 334 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCTD1Q719H9 257 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ESR2Q92731 530 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKR1A1P14550 325 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANO1Q5XXA6 986 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDF15Q99988 308 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DSCC1Q9BVC3 393 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACAD9Q9H845 621 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.83■□□□□ 0.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF536O15090 1300 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC41Q15345 812 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms