RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 USP7Q93009 1102 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ISL2Q96A47 359 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 C1orf159Q96HA4 380 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 IFT22Q9H7X7 185 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TNKSO95271 1327 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 M0R2C6 588 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CREB3O43889 395 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MYL1P05976 194 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MAP4K2Q12851 820 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MLC1Q15049 377 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PASD1Q8IV76 773 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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HERC3-209ENST00000504994 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 VWCEQ96DN2 955 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 IGF1RP08069 1367 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 E2F8A0AVK6 867 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ABLIM3O94929 683 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 WISP1O95388 367 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 CRTAMO95727 393 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ADH5P11766 374 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 FLT3P36888 993 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ZNF445P59923 1031 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 CYP4F3Q08477 520 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 NXNQ6DKJ4 435 aa6.52□□□□□ -1.37
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HERC3-209ENST00000504994 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 KCT2Q8NC54 265 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 FOXQ1Q9C009 403 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.52□□□□□ -1.37
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HERC3-209ENST00000504994 NID1P14543 1247 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 KCNJ6P48051 423 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 PPP2R5DQ14738 602 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 USP53Q70EK8 1073 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 CHSY3Q70JA7 882 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 EVI5LQ96CN4 794 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ZEB2O60315 1214 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 SCG5P05408 212 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 PYGMP11217 842 aa6.5□□□□□ -1.37
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HERC3-209ENST00000504994 HOXC12P31275 282 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.5□□□□□ -1.37
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HERC3-209ENST00000504994 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 NXPE1Q8N323 547 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-209ENST00000504994 FIBCD1Q8N539 461 aa6.5□□□□□ -1.37
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