RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC17Q96LX7 622 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMYND12Q9H0C1 365 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 TPM3P06753 285 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PDHBP11177 359 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CDC25BP30305 580 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PTGDRQ13258 359 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PNOCQ13519 176 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 NCAPHQ15003 741 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 IL17AQ16552 155 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ASPRV1Q53RT3 343 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CNNM3Q8NE01 707 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC148Q8NFR7 591 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMD1Q99460 953 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJC18Q9H819 358 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087X0B3 334 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ESYT2A0FGR8 921 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXN1O15353 648 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ENTPD3O75355 529 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL1O95922 423 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 KANK3Q6NY19 840 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 TATDN1Q6P1N9 297 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 AOPEPQ8N6M6 819 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA20Q8TB22 786 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MKL1Q969V6 931 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 GMLQ99445 158 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CPVLQ9H3G5 476 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CLIP2Q9UDT6 1046 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 BECN2A8MW95 431 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 hCG_1984214I3L0E3 225 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 BIN1O00499 593 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 IKBKBO14920 756 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIP5K2O43314 1243 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PLCB2Q00722 1185 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF543Q08ER8 600 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MTMR8Q96EF0 704 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 EPSTI1Q96J88 318 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGSQ96S52 555 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM5Q9C035 493 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 UBA5Q9GZZ9 404 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS33BQ9H267 617 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CREBZFQ9NS37 354 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PI4KBQ9UBF8 816 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ATRNL1Q5VV63 1379 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SMTNL1A8MU46 457 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 VIL1P09327 827 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SLFN14P0C7P3 912 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR29P0C7W0 189 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SLURP2P0DP57 97 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 BMP6P22004 513 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNB3P54284 484 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MORC3Q14149 939 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 POSTNQ15063 836 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 E2F4Q16254 413 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP100Q494V2 611 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 LDHDQ86WU2 507 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SIAH1Q8IUQ4 282 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 NYAP2Q9P242 653 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 MTMR7Q9Y216 660 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms