RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 TGFB2P61812 414 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CCDC125Q86Z20 511 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 MTMR8Q96EF0 704 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PSMD14O00487 310 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SPDYE6P0CI01 402 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PLCB2Q00722 1185 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 IL17AQ16552 155 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SPATA20Q8TB22 786 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 A0A087X0B3 334 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 GNA11P29992 359 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 POSTNQ15063 836 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 EPSTI1Q96J88 318 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 C6orf50Q9HD87 102 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 BECN2A8MW95 431 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 BIN1O00499 593 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 FOXN1O15353 648 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MCM7P33993 719 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SMCO2A6NFE2 343 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 IKBKBO14920 756 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 NCAPHQ15003 741 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 TPM3P06753 285 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SLFN14P0C7P3 912 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 HOMER1Q86YM7 354 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 TRIM5Q9C035 493 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 FAM196BA6NMK8 535 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 LAD1O00515 517 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 RAD17O75943 681 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 E2F4Q16254 413 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 INF2Q27J81 1249 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 DCAF4Q8WV16 495 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PIM2Q9P1W9 311 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PRR29P0C7W0 189 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 BMP6P22004 513 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PRPHP41219 470 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SMTNL1A8MU46 457 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 MORC3Q14149 939 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 PDILTQ8N807 584 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-211ENST00000492185 CNTNAP1P78357 1384 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 SEPT2Q15019 361 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 NIM1KQ8IY84 436 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 MTFR1LQ9H019 292 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-211ENST00000492185 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.7■■□□□ 1.22
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