RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488711.1

EHD1-210, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-210ENST00000488711 SLC4A3P48751 1232 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 CPXCR1Q8N123 301 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 MAML3Q96JK9 1138 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 STX8Q9UNK0 236 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 RIPK3Q9Y572 518 aa24.1■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 BMP3P12645 472 aa24.09■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.09■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.09■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.09■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 TOMM22Q9NS69 142 aa24.09■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.09■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 HAND2P61296 217 aa24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 KCTD2Q14681 263 aa24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 ANO1Q5XXA6 986 aa24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 TICAM2Q86XR7 235 aa24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 FEM1BQ9UK73 627 aa24.08■■□□□ 1.45
EHD1-210ENST00000488711 TMEM232C9JQI7 657 aa24.07■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 ORC4O43929 436 aa24.07■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 ZBED4O75132 1171 aa24.07■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 COL6A1P12109 1028 aa24.07■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 FGRP09769 529 aa24.06■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 MCCP23508 829 aa24.06■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 COPB2P35606 906 aa24.06■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.06■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 MTMR7Q9Y216 660 aa24.06■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 MSCO60682 206 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 PDE4AP27815 886 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 SLC1A4P43007 532 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 KCTD1Q719H9 257 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 GMCL1Q96IK5 515 aa24.04■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 ZMYM6O95789 1325 aa24.04■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 ATP2A1O14983 1001 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 SEPT4O43236 478 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 STAT2P52630 851 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 TINF2Q9BSI4 451 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.03■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 SYN1P17600 705 aa24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 SNAP25P60880 206 aa24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 DDX11Q96FC9 970 aa24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 PRO3102Q9H379 93 aa24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
EHD1-210ENST00000488711 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 NOVP48745 357 aa24.01■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.01■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.01■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 FAM160B2Q86V87 743 aa24■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 CHURC1Q8WUH1 139 aa24■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 DNM1LO00429 736 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 OAZ1P54368 228 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 CCDC96Q2M329 555 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 ZNF536O15090 1300 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 NEDD4P46934 1319 aa23.99■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 CCDC174Q6PII3 467 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 CHST13Q8NET6 341 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 IL25Q9H293 177 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.98■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 HIP1O00291 1037 aa23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 FDX1P10109 184 aa23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 FBXO40Q9UH90 709 aa23.97■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
EHD1-210ENST00000488711 ZNF213O14771 459 aa23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms