RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488023.1

HFM1-208, Transcript of HFM1, ATP dependent DNA helicase homolog, human

TSL 5

Gene HFM1, Length 1,699 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HFM1-208	ENST00000488023	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	APPBP2	Q92624	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GFRA2	O00451	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CILP	O75339	1184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	F13A1	P00488	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CDK8	P49336	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	LINC00310	P59036	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SEPT6	Q14141	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PMM1	Q92871	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	BMP7	P18075	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GLDC	P23378	1020 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CRK	P46108	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MASP1	P48740	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	EVA1C	P58658	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	NFIX	Q14938	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	RAC2	P15153	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GRK4	P32298	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PDE4B	Q07343	736 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	KCNN1	Q92952	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SHD	Q96IW2	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MIPEP	Q99797	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CBX7	O95931	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PGR	P06401	933 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CYP7A1	P22680	504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	TBX4	P57082	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ERVFC1	P60507	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	NKG7	Q16617	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms