RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 CPXCR1Q8N123 301 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 FEM1BQ9UK73 627 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 STX8Q9UNK0 236 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.27■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ZBED4O75132 1171 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 TOMM22Q9NS69 142 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 TMEM232C9JQI7 657 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 FGRP09769 529 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 COL6A1P12109 1028 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 MCCP23508 829 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 COPB2P35606 906 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 HAND2P61296 217 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ANO1Q5XXA6 986 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ATP2A1O14983 1001 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ORC4O43929 436 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 MSCO60682 206 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 MYH4Q9Y623 1939 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 SLC1A4P43007 532 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 GMCL1Q96IK5 515 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 MTMR7Q9Y216 660 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 SEPT4O43236 478 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 KCTD1Q719H9 257 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 TINF2Q9BSI4 451 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 ZMYM6O95789 1325 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 CEP290O15078 2479 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 PDE4AP27815 886 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 NOVP48745 357 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 STAT2P52630 851 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 DDX11Q96FC9 970 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-211ENST00000482015 SYN1P17600 705 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 FAM160B2Q86V87 743 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 PRO3102Q9H379 93 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ALPK3Q96L96 1907 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 DNM1LO00429 736 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 OAZ1P54368 228 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 SNAP25P60880 206 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ZNF536O15090 1300 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 HIP1O00291 1037 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 PLA2G6O60733 806 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 FDX1P10109 184 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 CHST13Q8NET6 341 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 FBXO40Q9UH90 709 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 NEDD4P46934 1319 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ZNF213O14771 459 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 CCDC96Q2M329 555 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 CCDC174Q6PII3 467 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 DCAF4Q8WV16 495 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 IL25Q9H293 177 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms