RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481269.1

CSNK2B-208, Transcript of casein kinase 2 beta, human

TSL 2

Gene CSNK2B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCNA1	P78396	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSNK2B-208	ENST00000481269	TRANK1	O15050	2925 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	LPXN	O60711	386 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	LDHC	P07864	332 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATP5J	P18859	108 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ADORA1	P30542	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TAP1	Q03518	808 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ACACB	O00763	2458 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	GBF1	Q92538	1859 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	MTMR2	Q13614	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	GRB14	Q14449	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	RGS3	P49796	1198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	HIP1	O00291	1037 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	AVPR2	P30518	371 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	NBL1	P41271	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	ACLY	P53396	1101 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	PDE1A	P54750	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	HAUS7	Q99871	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TECTA	O75443	2155 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	BAG3	O95817	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	IGHA2	P01877	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	PLCG2	P16885	1265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	MCAM	P43121	646 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	GOLIM4	O00461	696 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCL23	P55773	120 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSNK2B-208	ENST00000481269	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK2B-208	ENST00000481269	ENTPD3	O75355	529 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK2B-208	ENST00000481269	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZAP70	P43403	619 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK2B-208	ENST00000481269	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK2B-208	ENST00000481269	BACE1	P56817	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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