RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 UNC80Q8N2C7 3258 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 VCPKMTQ9H867 229 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 PHF24Q9UPV7 400 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L12C9JPN9 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L21D6R901 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 FCER1AP12319 257 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ADD2P35612 726 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ICA1Q05084 483 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 RIOX2Q8IUF8 465 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 MB21D1Q8N884 522 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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CTPS1-208ENST00000479480 MMP19Q99542 508 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 TINF2Q9BSI4 451 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SWAP70Q9UH65 585 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 FOCADQ5VW36 1801 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 MYH1P12882 1939 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0355O15063 1070 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 MBD4O95243 580 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A27O95847 323 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 STAT3P40763 770 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 FAAP100Q0VG06 881 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 REPS2Q8NFH8 660 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC17Q96LX7 622 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 RIPK3Q9Y572 518 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 EYSQ5T1H1 3165 aa10.18□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PQY0 241 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 VWA5AO00534 786 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 GPR37O15354 613 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS4O75173 837 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 CLTBP09497 229 aa10.17□□□□□ -0.78
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CTPS1-208ENST00000479480 RARBP10826 455 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 GRIN2CQ14957 1233 aa10.17□□□□□ -0.78
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CTPS1-208ENST00000479480 CTR9Q6PD62 1173 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
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CTPS1-208ENST00000479480 ZMYND10O75800 440 aa10.16□□□□□ -0.78
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CTPS1-208ENST00000479480 ATP5JP18859 108 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 KCTD2Q14681 263 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 RNF180Q86T96 592 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 USP38Q8NB14 1042 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 KLHDC9Q8NEP7 349 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
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CTPS1-208ENST00000479480 RLFQ13129 1914 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 RAD21O60216 631 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 FOSL2P15408 326 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A3P48751 1232 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 ACLYP53396 1101 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 KCNA10Q16322 511 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 HAUS7Q99871 368 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SH2D4AQ9H788 454 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 PRDM6Q9NQX0 595 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-208ENST00000479480 FRMPD3Q5JV73 1810 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa10.14□□□□□ -0.79
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