RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.97■■□□□ 1.27
AUP1-207ENST00000472800 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.97■■□□□ 1.27
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AUP1-207ENST00000472800 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.96■■□□□ 1.27
AUP1-207ENST00000472800 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AUP1-207ENST00000472800 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AUP1-207ENST00000472800 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.96■■□□□ 1.27
AUP1-207ENST00000472800 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.96■■□□□ 1.27
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AUP1-207ENST00000472800 CPA4Q9UI42 421 aa22.96■■□□□ 1.27
AUP1-207ENST00000472800 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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AUP1-207ENST00000472800 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 PPP2R5BQ15173 497 aa22.94■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.94■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.94■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.93■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.93■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.93■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.93■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 KLRF2D3W0D1 207 aa22.92■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 CCNA1P78396 465 aa22.92■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 ARHGEF6Q15052 776 aa22.92■■□□□ 1.26
AUP1-207ENST00000472800 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.92■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.92■■□□□ 1.26
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AUP1-207ENST00000472800 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
AUP1-207ENST00000472800 MAPK4P31152 587 aa22.87■■□□□ 1.25
AUP1-207ENST00000472800 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.87■■□□□ 1.25
AUP1-207ENST00000472800 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AUP1-207ENST00000472800 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.86■■□□□ 1.25
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