RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462927.5

CYTH4-208, Transcript of cytohesin 4, human

TSL 2

Gene CYTH4, Length 3,667 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYTH4-208	ENST00000462927	SCRN1	Q12765	414 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	TULP2	O00295	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PRKG1	Q13976	671 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	GDF11	O95390	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SERPINC1	P01008	464 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	RASA3	Q14644	834 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ENTPD3	O75355	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PHKB	Q93100	1093 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ORC4	O43929	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	RASA1	P20936	1047 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	FANCC	Q00597	558 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	RTN1	Q16799	776 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	AKR1B1	P15121	316 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	LMAN1	P49257	510 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	NDUFA8	P51970	172 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PFKFB2	O60825	505 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CASQ1	P31415	396 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	UBASH3A	P57075	661 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	MYH1	P12882	1939 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	LIFR	P42702	1097 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	GNG11	P61952	73 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYTH4-208	ENST00000462927	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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