RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP2A1O14983 1001 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 PRC1O43663 620 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 MCM5P33992 734 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 IRF5Q13568 498 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 PLS1Q14651 629 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 MORN1Q5T089 497 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 MTA3Q9BTC8 594 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 USP26Q9BXU7 913 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ZBED4O75132 1171 aa24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 FDX1P10109 184 aa24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ERCC3P19447 782 aa24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 STAT3P40763 770 aa24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 NEK1Q96PY6 1258 aa24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ERICH2A1L162 156 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 PTPREP23469 700 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC16A2P36021 539 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 WTAPQ15007 396 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 RAET1EQ8TD07 263 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ARMC5Q96C12 935 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 MROH8Q9H579 483 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 LY9Q9HBG7 655 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.14■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF536O15090 1300 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC25A27O95847 323 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 OAZ1P54368 228 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 KRT32Q14532 448 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM87BQ96K49 555 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 RIPK3Q9Y572 518 aa24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 TROAPQ12815 778 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 GRB14Q14449 540 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 WDR78Q5VTH9 848 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CPXCR1Q8N123 301 aa24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 BRCA2P51587 3418 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 STRNO43815 780 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ADCY3O60266 1144 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SNAP25P60880 206 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CPVLQ9H3G5 476 aa24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 GRK4P32298 578 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 LIFRP42702 1097 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF333Q96JL9 665 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ELNP15502 786 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CYP2B6P20813 491 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 COPB2P35606 906 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 MAP2K5Q13163 448 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 HOXC6P09630 235 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 ADORA2AP29274 412 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 RGS2P41220 211 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 GRM4Q14833 912 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 NBPF11Q86T75 865 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 TMTC2Q8N394 836 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC174Q6PII3 467 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms