RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 STRNO43815 780 aa28.21■■■□□ 2.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.19■■■□□ 2.1
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SH3BP5-208ENST00000459627 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.16■■■□□ 2.1
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF792Q3KQV3 632 aa28.13■■■□□ 2.09
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SH3BP5-208ENST00000459627 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.13■■■□□ 2.09
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF536O15090 1300 aa28.13■■■□□ 2.09
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SH3BP5-208ENST00000459627 IQCA1Q86XH1 822 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD35Q8N283 1001 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF146Q9NTX7 359 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 TNKSO95271 1327 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-208ENST00000459627 SMCHD1A6NHR9 2005 aa28.08■■■□□ 2.08
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