RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 KIFC2Q96AC6 838 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CNMDO75829 334 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 BTBD7Q9P203 1132 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 PCNTO95613 3336 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 MGAMO43451 1857 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ZBED4O75132 1171 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ERVK-9P63128 1117 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ERVK-24P63145 666 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 Q3C1V9 767 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 APOA5Q6Q788 366 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 BRF1Q92994 677 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 KIF5BP33176 963 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 SLC16A2P36021 539 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 EVCP57679 992 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 KIF22Q14807 665 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 REPS2Q8NFH8 660 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ERO1AQ96HE7 468 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 KLRF2D3W0D1 207 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 RCAN1P53805 252 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CCNA1P78396 465 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 KIF2CQ99661 725 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 MYL10Q9BUA6 226 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ATP2A1O14983 1001 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 GNAQP50148 359 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 NEK4P51957 841 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 APOBRQ0VD83 1088 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF6Q15052 776 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 FANCBQ8NB91 859 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ZBTB43O43298 467 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PEX10O60683 326 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 SMARCA1P28370 1054 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 OAZ1P54368 228 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PPP2R5BQ15173 497 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 IL27Q8NEV9 243 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 LZTS2Q9BRK4 669 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 MYH6P13533 1939 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 STAT3P40763 770 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PLS1Q14651 629 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD1Q15327 319 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 SLC25A27O95847 323 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 MAPK4P31152 587 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PSMC4P43686 418 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 MICU3Q86XE3 530 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 CPVLQ9H3G5 476 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PNMA2Q9UL42 364 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 GNRH1P01148 92 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 RXRAP19793 462 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 COPB2P35606 906 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 FCGRTP55899 365 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 CPXCR1Q8N123 301 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PORCNQ9H237 461 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 ZNF536O15090 1300 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.96■■□□□ 1.43
PMS1-211ENST00000424766 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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