RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411419.6

CTBP2-205, Transcript of C-terminal binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2-205ENST00000411419 MTRQ99707 1265 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 USP17L5A8MUK1 530 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SMARCA1P28370 1054 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 INF2Q27J81 1249 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 MSL1Q68DK7 614 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 USP40Q9NVE5 1235 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SCNN1DP51172 638 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SLC15A2Q16348 729 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PTPN21Q16825 1174 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.17■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 AKR1B1P15121 316 aa22.17■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 CUL4BQ13620 913 aa22.17■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.17■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 CDC25AP30304 524 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 NAPAP54920 295 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 HOMER1Q86YM7 354 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 TSC1Q92574 1164 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PIGSQ96S52 555 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SMCO2A6NFE2 343 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 PDHBP11177 359 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 STK32BQ9NY57 414 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.14■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
CTBP2-205ENST00000411419 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 BAG6P46379 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SPATA1Q5VX52 437 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 MYH8P13535 1937 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 G3V3G9 751 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 KCNJ6P48051 423 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 STX17P56962 302 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 CEP135Q66GS9 1140 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 TMX1Q9H3N1 280 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 C6orf50Q9HD87 102 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SNHG28P0DPA3 235 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SHMT1P34896 483 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 PTPN14Q15678 1187 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 TEKT1Q969V4 418 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SWAP70Q9UH65 585 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 PP2D1A8MPX8 630 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 GNA11P29992 359 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 TXLNAP40222 546 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 NFIAQ12857 509 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 NR1I3Q14994 352 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 DISC1Q9NRI5 854 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 LAD1O00515 517 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 PRPHP41219 470 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 CRKP46108 304 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP2-205ENST00000411419 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.138e-7■■■□□ 17.3
CTBP2-205ENST00000411419 SOGA3Q5TF21 947 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms