RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 LONRF3Q496Y0 759 aa21.65■■□□□ 1.06
USP39-202ENST00000409025 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.65■■□□□ 1.06
USP39-202ENST00000409025 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
USP39-202ENST00000409025 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
USP39-202ENST00000409025 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.64■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 MKL1Q969V6 931 aa21.64■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.64■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SMCO2A6NFE2 343 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ESPNB1AK53 854 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 MCM7P33993 719 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 IQCB1Q15051 598 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CCDC96Q2M329 555 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CSRNP1Q96S65 589 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 NLRP12P59046 1061 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.63■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 A0A087WWV3 80 aa21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ESYT2A0FGR8 921 aa21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CLRN2A0PK11 232 aa21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 AP5Z1O43299 807 aa21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 JDP2Q8WYK2 163 aa21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 BECN2A8MW95 431 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ICA1Q05084 483 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CXCL9Q07325 125 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SEPT2Q15019 361 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 KANK3Q6NY19 840 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 FAM151AQ8WW52 585 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 GDF11O95390 407 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 PNOCQ13519 176 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 DCAF4Q8WV16 495 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.61■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 BIN1O00499 593 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 INF2Q27J81 1249 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 USP49Q70CQ1 688 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SLFN13Q68D06 897 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 KCTD1Q719H9 257 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 PDILTQ8N807 584 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 RAD21O60216 631 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 EPSTI1Q96J88 318 aa21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
USP39-202ENST00000409025 MYO1BO43795 1136 aa21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SLC1A4P43007 532 aa21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 POSTNQ15063 836 aa21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 COA7Q96BR5 231 aa21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 VEZTQ9HBM0 779 aa21.58■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 GH2P01242 217 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ADCY7P51828 1080 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 TNIP1Q15025 636 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 CNTNAP1P78357 1384 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 SLC16A2P36021 539 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.57■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 USP17L10C9JJH3 530 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 NFKBIEO00221 500 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 LAD1O00515 517 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 ZBTB5O15062 677 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 DHX58Q96C10 678 aa21.56■■□□□ 1.04
USP39-202ENST00000409025 MTMR8Q96EF0 704 aa21.56■■□□□ 1.04
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