RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 BARHL2Q9NY43 387 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.378e-10■■□□□ 12.2
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ATG4B-204ENST00000402096 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP45Q9UL16 551 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 STXBP3O00186 592 aa23.58■■□□□ 1.37
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ATG4B-204ENST00000402096 POTEJP0CG39 1038 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRAP18433 802 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 OXER1Q8TDS5 423 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-204ENST00000402096 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 CALML3P27482 149 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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ATG4B-204ENST00000402096 MAP3K9P80192 1104 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 NR5A1Q13285 461 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA32Q96LK8 384 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SPP2Q13103 211 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 MTMR2Q13614 643 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 CSADQ9Y600 493 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB5O15062 677 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ATL3Q6DD88 541 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 WDR18Q9BV38 432 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM75PA6NK02 468 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 USP14P54578 494 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 VGLL4Q14135 290 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 COA7Q96BR5 231 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 USP28Q96RU2 1077 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 TRAK2O60296 914 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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ATG4B-204ENST00000402096 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 LPAR1Q92633 364 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 MTMR8Q96EF0 704 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 BACE1P56817 501 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SNAP25P60880 206 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 DGKZQ13574 1117 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 NPY5RQ15761 445 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 C6orf50Q9HD87 102 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SMCO2A6NFE2 343 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 GALNT17Q6IS24 598 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 FAM160B2Q86V87 743 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 KIFC2Q96AC6 838 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 FEM1BQ9UK73 627 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 MOB2Q70IA6 237 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-204ENST00000402096 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 GNA11P29992 359 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 CLIC4Q9Y696 253 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 TRAF5O00463 557 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 STK38Q15208 465 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 ELP3Q9H9T3 547 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 ELP1O95163 1332 aa23.51■■□□□ 1.35
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