RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 SH2D4AQ9H788 454 aa23.35■■□□□ 1.33
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HDDC3-202ENST00000394272 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 GALNT17Q6IS24 598 aa23.34■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.34■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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HDDC3-202ENST00000394272 VCPKMTQ9H867 229 aa23.34■■□□□ 1.33
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HDDC3-202ENST00000394272 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.34■■□□□ 1.33
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HDDC3-202ENST00000394272 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.34■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L10C9JJH3 530 aa23.33■■□□□ 1.33
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HDDC3-202ENST00000394272 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.32■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 STK38Q15208 465 aa23.32■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PTPAQ15257 358 aa23.32■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.32■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 KLRG1Q96E93 195 aa23.32■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 WRNIP1Q96S55 665 aa23.32■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 ESYT2A0FGR8 921 aa23.31■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 FAM205CA6NFA0 338 aa23.31■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 SLC39A14Q15043 492 aa23.31■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 SULF1Q8IWU6 871 aa23.31■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.31■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.31■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 FZD1Q9UP38 647 aa23.3■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.3■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 POTECB2RU33 542 aa23.3■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.3■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.29■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 ADM5C9JUS6 153 aa23.29■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.29■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 SMCO2A6NFE2 343 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 GNA11P29992 359 aa23.28■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 FEZ1Q99689 392 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 C6orf50Q9HD87 102 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2G6O60733 806 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PPP6R2O75170 966 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 ME1P48163 572 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 STAT2P52630 851 aa23.28■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.28■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.27■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.27■■□□□ 1.32
HDDC3-202ENST00000394272 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
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HDDC3-202ENST00000394272 TRAPPC10P48553 1259 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 ADALQ6DHV7 355 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 LPAR1Q92633 364 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 PICK1Q9NRD5 415 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 OTOFQ9HC10 1997 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 LIG1P18858 919 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 GSE1Q14687 1217 aa23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HDDC3-202ENST00000394272 WNT7AO00755 349 aa23.25■■□□□ 1.31
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