RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 MCCP23508 829 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 COPB2P35606 906 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 NOVP48745 357 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CPXCR1Q8N123 301 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP19Q99542 508 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 IL25Q9H293 177 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR7Q9Y216 660 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 NEDD4P46934 1319 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2C19P33261 490 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A3P48751 1232 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 STAT2P52630 851 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD2Q14681 263 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD1Q719H9 257 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM160B2Q86V87 743 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 RIPK3Q9Y572 518 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD50Q92878 1312 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2A1O14983 1001 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHA2P01877 340 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 PGK2P07205 417 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMLP26374 656 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 ESR2Q92731 530 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC96Q2M329 555 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF4Q8WV16 495 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 DPF3Q92784 378 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 MAML3Q96JK9 1138 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 FDX1P10109 184 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CNGA1P29973 690 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 OAZ1P54368 228 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 LHX8Q68G74 356 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPV1Q8NER1 839 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G6O60733 806 aa23.83■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM4AO75164 1064 aa23.83■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 CYBAP13498 195 aa23.83■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.83■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC14Q96N46 770 aa23.83■■□□□ 1.41
ANKRD39-201ENST00000393537 B4E1Z4 1266 aa23.82■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.82■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.82■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5C2P49902 561 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 SNAP25P60880 206 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX11Q96FC9 970 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 PTH1RQ03431 593 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 IQCA1Q86XH1 822 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 CHST13Q8NET6 341 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO40Q9UH90 709 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 ALPK3Q96L96 1907 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF536O15090 1300 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 SGSM2O43147 1006 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 MSCO60682 206 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 PDHBP11177 359 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC16A2P36021 539 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC174Q6PII3 467 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKHQ86XP1 1220 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT23Q9C075 422 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 H0YGN5 161 aa23.78■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.78■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.78■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 SKAP1Q86WV1 359 aa23.78■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.78■■□□□ 1.4
ANKRD39-201ENST00000393537 TINF2Q9BSI4 451 aa23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms