RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM247A6NEH6 219 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf81A6NN90 581 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO21O94952 628 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 UPP2O95045 317 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 INIPQ9NRY2 104 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 BPIFB4P59827 614 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CNGA3Q16281 694 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 USP48Q86UV5 1035 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PAF1Q8N7H5 531 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC89Q8N998 374 aa7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CASS4Q9NQ75 786 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 STAT3P40763 770 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PXDNQ92626 1479 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PRQ8 180 aa7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 DESP17661 470 aa7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NJR5 290 aa7.61□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ANXA13P27216 316 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCY2FP51841 1108 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PHEXP78562 749 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 SP140Q13342 867 aa7.61□□□□□ -1.19
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