RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PAK1Q13153 545 aa24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CD302Q8IX05 232 aa24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.27■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.27■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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OPN3-201ENST00000366554 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.27■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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OPN3-201ENST00000366554 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.27■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.27■■□□□ 1.48
OPN3-201ENST00000366554 B4E1Z4 1266 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CLSTN1O94985 981 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 LRRC24Q50LG9 513 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 DNM1LO00429 736 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CFAP58Q5T655 872 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.26■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 TRIM58Q8NG06 486 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 OXER1Q8TDS5 423 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 NELFBQ8WX92 580 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CABP5Q9NP86 173 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 LTN1O94822 1766 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 VAV2P52735 878 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.25■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 XDHP47989 1333 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 EYA2O00167 538 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 KIF5AQ12840 1032 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 STAMQ92783 540 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 E7EVH7 732 aa24.24■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 LIFRP42702 1097 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.24■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ZNF790Q6PG37 636 aa24.24■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.24■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 MREGQ8N565 214 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 RNF217Q8TC41 542 aa24.23■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CYP27A1Q02318 531 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 C3orf20Q8ND61 904 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SCLT1Q96NL6 688 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.23■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SLC39A6Q13433 755 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.22■■□□□ 1.47
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OPN3-201ENST00000366554 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 H7C1D1 291 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 FAM153BP0C7A2 387 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SLC8A3P57103 927 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 XRCC4Q13426 336 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 E2F5Q15329 346 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 FAM153CQ494X1 144 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 GDF3Q9NR23 364 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.22■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 TRIM75PA6NK02 468 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 INHBEP58166 350 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SCARF1Q14162 830 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 C8orf74Q6P047 294 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 C5P01031 1676 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 NID2Q14112 1375 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ZNF263O14978 683 aa24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
OPN3-201ENST00000366554 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
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