RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 BTBD19C9JJ37 291 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 SPZ1Q9BXG8 430 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 UBA5Q9GZZ9 404 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 PNMA3Q9UL41 463 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 SLC16A2P36021 539 aa32.26■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 IFNAR1P17181 557 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 OSBPP22059 807 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 COG2Q14746 738 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 SYDE2Q5VT97 1194 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO28Q9NVF7 368 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 MYPNQ86TC9 1320 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 ST3GAL1Q11201 340 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 NTRK3Q16288 839 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 HOXC10Q9NYD6 342 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 PDHXO00330 501 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 PARP14Q460N5 1801 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC82Q8N4S0 544 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 KIFC2Q96AC6 838 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN18Q99952 460 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 CPVLQ9H3G5 476 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 RIOX1Q9H6W3 641 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 CUL4AQ13619 759 aa32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 NBPF11Q86T75 865 aa32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 ADGRF4Q8IZF3 695 aa32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 PRR12Q9ULL5 1215 aa32.23■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 TM4SF4P48230 202 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 VEGFBP49765 207 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 CYTH3O43739 400 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 AOC2O75106 756 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 FDX1P10109 184 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 DSG3P32926 999 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 FUT2Q10981 343 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 IFNL1Q8IU54 200 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 MAP2K2P36507 400 aa32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM22Q8IYM9 498 aa32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 ZIC5Q96T25 663 aa32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 VAT1LQ9HCJ6 419 aa32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 RLFQ13129 1914 aa32.2■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 JMJD4Q9H9V9 463 aa32.2■■■□□ 2.75
GIPC1-201ENST00000345425 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 CTDNEP1O95476 244 aa32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SLC35G1Q2M3R5 365 aa32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 PHKBQ93100 1093 aa32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SLC26A6Q9BXS9 759 aa32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 ATG4CQ96DT6 458 aa32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 PTPDC1A2A3K4 754 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 HERVK_113P62684 666 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 LBX2Q6XYB7 198 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR8Q96EF0 704 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 STK36Q9NRP7 1315 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 VWA5AO00534 786 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 ZBED4O75132 1171 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 HOMER1Q86YM7 354 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 MB21D1Q8N884 522 aa32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 V9GY48 417 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB5O15062 677 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 ALDH1A1P00352 501 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 PIGSQ96S52 555 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa32.16■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 THSD7BQ9C0I4 1608 aa32.15■■■□□ 2.74
GIPC1-201ENST00000345425 PIBF1Q8WXW3 757 aa32.15■■■□□ 2.74
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