RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 CEP85Q6P2H3 762 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MID2Q9UJV3 735 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 EXOC5O00471 708 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 KCNK3O14649 394 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ATP2B3Q16720 1220 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 GSDMAQ96QA5 445 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 BIRC2Q13490 618 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MORC3Q14149 939 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 RAB20Q9NX57 234 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 IKBKBO14920 756 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 AP2B1P63010 937 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ATG16L1Q676U5 607 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 APOA1P02647 267 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 UIMC1Q96RL1 719 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PQ27 194 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PQ64 194 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PQD8 194 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 STX1BP61266 288 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PBKQ96KB5 322 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 CUEDC2Q9H467 287 aa8.99□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 H0YCG3 227 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 NXNQ6DKJ4 435 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 GSTA1P08263 222 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 GSTA2P09210 222 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 GUCY2DQ02846 1103 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 STXBP3O00186 592 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 DAPK3O43293 454 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PHKBQ93100 1093 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 E2F4Q16254 413 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TADA3O75528 432 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 SERPINB2P05120 415 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 KRT8P05787 483 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 INHBAP08476 426 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 SESTD1Q86VW0 696 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TEX11Q8IYF3 940 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 SYNMO15061 1565 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 CACNA1FO60840 1977 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TNNI2P48788 182 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 CLCN6P51797 869 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 RRAGAQ7L523 313 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TTC38Q5R3I4 469 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 KDM1AO60341 852 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 STAM2O75886 525 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.98□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ATP6V1E1P36543 226 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 NNTQ13423 1086 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 KRT39Q6A163 491 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 PANX2Q96RD6 677 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 FMO2Q99518 471 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 NBPF3Q9H094 633 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MAML3Q96JK9 1138 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 MRGBPQ9NV56 204 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 CUL3Q13618 768 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 E2F5Q15329 346 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.97□□□□□ -0.97
PKHD1-201ENST00000340994 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms